09.12.08 Einzigartige Sulfotransferase in pathogenen E. coli-Stämmen gefunden
Sulfat-Pingpong in den Harnwegen
Es ist selten, dass man für bekannte Prozesse noch völlig neue Proteinstrukturen findet. Doch genau das gelang ETH-Molekularbiologen. Sie untersuchten das Protein ASST, das in pathogenen E. coli-Bakterien vorkommt, die Harnwegsinfektionen verursachen. Neben der neuen Struktur stiessen die Forscher auch noch auf einen Pingpong-ähnlichen Übertragungsmechanismus, bei dem der „Ball“ auf bisher nicht beobachtete Weise festgehalten wird.
Christoph Meier (ETHZ)
Abb. 1: Die ASST-Struktur, wie man sie aufgrund der
Röntgenanalyse errechnete. Die nicht gelben, farbigen Teile sind die
propellerähnlichen Unterstrukturen. Sie bilden eine trichterförmige Röhre, in
der das aktive Zentrum liegt.
Quelle: ETHZ
Informationsübertragung ist ein grundlegender Vorgang in biologischen Systemen. Die meisten denken dabei an die Übertragung von Erbinformation oder das Feuern von Nervenzellen. Auf einer noch fundamentaleren Stufe laufen die Signalübertragungen in und zwischen Zellen ab. Hier kommen Signalmoleküle zum Einsatz, die beispielsweise Phosphat- oder Sulfatgruppen enthalten. Da diese Prozesse so grundlegend sind, widmete ihnen die Forschung viel Zeit, so dass eine grosse Zahl an Abläufen und involvierten Strukturen bekannt sind. Umso überraschender ist es, dass die Gruppe um Rudolf Glockshuber bei einem Übertragungsprozess mit sulfatierten Molekülen auf ein Sulfotransferase-Enzym stiess, das eine bisher unbekannte Struktur aufweist.
ETH-Forscher kamen über Disulfidbrücke
Wie oft in der Forschung erfolgte die neue Einsicht in die Signalübertragung nicht von Forschern, welche genau diesen Prozess untersuchen wollten. Die Glockshuber-Gruppe ist seit längerem interessiert an Mechanismen der Proteinfaltung. Für diese spielen unter anderem Disulfidbrücken, Bindungen zwischen zwei Schwefelatomen der Proteinkette, eine wichtige Rolle. Als die Wissenschaftler Gendatenbanken durchforsteten, entdeckten sie bei E. coli-Stämmen, die Harnweginfektionen verursachen, eine interessante Kombination. Hier lagen nämlich zwei Proteine der Disulfidbrückenbau-Maschinerie neben ASST. Da in Bakterien häufig Gene beieinander liegen, die in einen gemeinsamen Prozess eingebunden sind, lag eine Vermutung nahe: ASST könnte ein geeignetes Protein sein, um Disulfidbrückenbildung zu studieren.
Die ETH-Forscher beschlossen darum, die Struktur von ASST aufzuklären. Das war aber gar nicht so einfach. Denn das Protein ist gross und kommt nur in geringen Mengen in einem als Periplasma bezeichneten Raum vor. Indem aber die Forscher die Bakterien im grossen Massstab züchteten, erhielten sie dann doch genügend Material, um die Proteine röntgenkristallographisch zu analysieren. Dafür züchteten sie Kristalle von ASST und untersuchten diese an der Swiss Light Source am Paul Scherrer Institut in Villigen.
Zwei Propeller, die einen Käfig bilden
Mit dieser Analyse, die eine Auflösung von zwei Ångström hatte, zeigte sich in der Tat, dass ASST eine Disulfidbrücke besitzt, die möglicherweise nur durch die mit ASST assoziierten Disulfid-Einbau-Enzyme gebildet werden kann, da die involvierten Cystein-Bausteine nahe beieinander liegen. Die Disulfidbrücke verantwortet die korrekte Faltung des Proteins und könnte auch die Aktivität des Proteins beeinflussen. Doch diese Erkenntnisse gerieten im Licht der anderen Befunde fast etwas in den Schatten. Denn den Forschern enthüllte sich eine bisher nie gesehene Proteinstruktur. Sie besteht aus zwei gleichen propellerartigen Teilen. Die Reaktionszentren liegen dabei jeweils im trichterförmigen Zentrum der beiden Propeller, die aus sogenannten β-Faltblattstrukturen gebildet werden. So etwas war für eine Sulfotransferase noch nie beschrieben worden.
Doch wie funktioniert diese Zweipropeller-Maschine? Um das herauszufinden, ersetzten die Forscher einerseits einzelne Aminosäuren, also die Bestandteile des Gesamtproteins. Andererseits gaben sie Stoffe hinzu, welche bei der Sulfatübertragung als Sulfat-Donoren fungieren. Erneut röntgenkristallographische aber auch biochemische Analysen komplementierten das Bild. Es zeigte sich, dass rund fünf stickstoffhaltige Aminosäuren für die Funktion von ASST zentral sind. Sie bilden einen Reaktionskäfig, in dem sowohl der Donor als auch der Empfänger der Sulfatgruppe gefangen gehalten wird. Sicher ist, dass während der Übergabe das Signalmolekül kovalent an eine Histidin-Seitenkette von ASST gebunden wird. Der „Ball“ in Form der Sulfatgruppe wird zuerst vom Sulfat-Donor zu ASST und nachher wieder zurück an den Empfänger gespielt. Auch dieser Pingppong-Mechanismus ist einzigartig.
Angriffspunkt gegen die „bösen“ E. coli-Stämme
Neue Struktur, neuer Mechanismus - das eröffnet Perspektiven, die möglicherweise
auch medizinisch relevant werden könnten. Goran Malojčić; Erstautor der Studie,
weist auf mehrere Aspekte hin: ASST kommt nicht in Säugern vor. Dadurch eignet
sich das Protein grundsätzlich als Angriffspunkt für Medikamente. Weiter ist von
Vorteil, dass ASST bisher nur in krankmachenden E. coli-Bakterienstämmen
gefunden wurde und in den anderen nicht. Schalte man das Protein also aus,
gefährde man nicht noch nützliche Bakterien.
Wie sich die Aktivität des Proteins beeinflussen lässt, möchte Malojčić in weiteren Studien herausfinden. So will er beispielsweise in Zusammenarbeit mit Medizinalchemikern am Computer Hemmstoffe für ASST entwickeln. Oder er kann sich auch vorstellen, mit Hilfe von ASST neue Moleküle mit Sulfatgruppen zu synthetisieren.
Quelle
A structural and biochemical basis for PAPS-independent sulfuryl transfer by aryl sulfotransferase from uropathogenic Escherichia coli
G. Malojčić, et. al., PNAS 2008, DOI:
10.1073/pnas.0806997105
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Einzigartige Sulfotransferase in pathogenen
E. coli-Stämmen gefunden
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